Das Desigo System gliedert sich in drei Netzwerkebenen:
- Management Level Network (MLN)
- Automation Level Network (ALN)
- Field Level Network (FLN)
Diese Unterteilung wird durch die Funktion bestimmt, die auf einer Ebene ausgeführt wird, und nicht durch das Kommunikationsprotokoll oder Medium. Auf dem MLN und ALN wird BACnet als Protokoll eingesetzt. Das Transport-Protokoll (Data Link Layer) ist LonTalk oder IP. Auf dem FLN wird LonWorks-, KNX- und MS/TP-Technologie eingesetzt.